<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="brief-report" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Clinical Laboratory Diagnostics</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Clinical Laboratory Diagnostics</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Клиническая лабораторная диагностика</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">0869-2084</issn><issn publication-format="electronic">2412-1320</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Eco-Vector</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">637164</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.17816/cld637164</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Short communications</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Краткие сообщения</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Short Communication</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Establishing an oral fluid repository: experience at the Ural State Medical University Biobank</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Создание депозитария образцов ротовой жидкости. Опыт биобанка Уральского государственного медицинского университета</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-8412-4315</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">6921-2766</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Maksimova</surname><given-names>Arina Yu.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Максимова</surname><given-names>Арина Юрьевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, Cand. Sci. (Medicine)</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>канд. мед. наук</p></bio><email>oreshek92@list.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-2797-1926</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">7232-3743</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kudryavtseva</surname><given-names>Elena V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Кудрявцева</surname><given-names>Елена Владимировна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, Dr. Sci. (Medicine), Assistant Professor</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д-р мед. наук, доцент</p></bio><email>elenavladpopova@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4921-7222</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">4391-5873</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Polushina</surname><given-names>Larisa G.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Полушина</surname><given-names>Лариса Георгиевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, Cand. Sci. (Medicine)</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>канд. мед. наук</p></bio><email>polushina-larisa@bk.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-6092-3734</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">5660-5708</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Kopenkin</surname><given-names>Maksim A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Копенкин</surname><given-names>Максим Александрович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><email>maximkopenkin@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-0966-9571</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">4813-8710</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bazarnyi</surname><given-names>Vladimir V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Базарный</surname><given-names>Владимир Викторович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>MD, Dr. Sci. (Medicine), Professor</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д-р мед. наук, профессор</p></bio><email>vlad-bazarny@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Ural State Medical University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Уральский государственный медицинский университет</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Ural State Medical University, Yekaterinburg</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Уральский государственный медицинский университет</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="preprint" iso-8601-date="2025-01-22" publication-format="electronic"><day>22</day><month>01</month><year>2025</year></pub-date><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2025-02-10" publication-format="electronic"><day>10</day><month>02</month><year>2025</year></pub-date><volume>69</volume><issue>9</issue><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>221</fpage><lpage>227</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2024-10-17"><day>17</day><month>10</month><year>2024</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2025-01-13"><day>13</day><month>01</month><year>2025</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2025, Maksimova A.Y., Kudryavtseva E.V., Polushina L.G., Kopenkin M.A., Bazarnyi V.V.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2025, Максимова А.Ю., Кудрявцева Е.В., Полушина Л.Г., Копенкин М.А., Базарный В.В.</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Maksimova A.Y., Kudryavtseva E.V., Polushina L.G., Kopenkin M.A., Bazarnyi V.V.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Максимова А.Ю., Кудрявцева Е.В., Полушина Л.Г., Копенкин М.А., Базарный В.В.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" start_date="2028-02-18"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://kld-journal.fedlab.ru/0869-2084/article/view/637164">https://kld-journal.fedlab.ru/0869-2084/article/view/637164</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>A biobank is a unique platform for modern applied and basic biomedical research. This department not only stores biological samples, but also systematizes the clinical and laboratory information for each sample. In 2023 a decision was made to create a biobank as part of the Central Research Laboratory at the Ural State Medical University. First, a type of biological material had to be selected to create a collection and associated information. The decision to form the first collection of oral fluid samples was driven by our long history of research in oral fluid biomarkers.</p> <p>The aim of this article is to describe the experience of establishing a university biobank based on a collection of oral fluid samples. The article reviews the major stages of establishing and operating a biobank, describes techniques for preparing oral fluid samples, and provides statistics on sample collections. Currently, the majority of oral fluid samples in the biobank are obtained from conditionally healthy patients and patients with various diseases. The studies used biobank collections to search for prognostic biomarkers of various medical conditions.</p> <p>Therefore, a university biobank is an opportunity for university staff to improve the quality and reproducibility of research and clinical trials.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Биобанк — это уникальная платформа для современных прикладных и фундаментальных биомедицинских исследований. Данное подразделение занимается не только хранением биологических образцов, но и систематизацией клинической, лабораторной информации по каждой пробе. В 2023 г. было принято решение сформировать биобанк на базе Центральной научно-исследовательской лаборатории Уральского государственного медицинского университета. Для начала было необходимо выбрать один тип биоматериала для создания коллекции и ассоциированной с ней информации. Поскольку нашим коллективом длительное время изучались биомаркеры ротовой жидкости, было принято решение создать первую коллекцию из образцов указанного биоматериала.</p> <p>Цель настоящей работы — представление опыта организации университетского биобанка на основе создания коллекции образцов ротовой жидкости. В статье рассматриваются основные этапы создания и функционирования биобанка, описываются методы пробоподготовки ротовой жидкости, а также приводится статистика собранных коллекций. На сегодняшний день преобладающая часть депозитария состоит из образцов ротовой жидкости условно здоровых пациентов и пациентов с различной патологией. На биоматериале из собранных коллекций биобанка выполнялись исследования по поиску прогностических биомаркеров различных патологических состояний.</p> <p>Таким образом, университетский биобанк — это возможность для сотрудников университета, которая поможет повысить качество и воспроизводимость научно-исследовательских работ и клинико-экспериментальных проектов.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>university biobank</kwd><kwd>biobanking</kwd><kwd>oral fluid</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>университетский биобанк</kwd><kwd>биобанкирование</kwd><kwd>ротовая жидкость</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Anisimov SV, Akhmerov TM, Balanovsky OP, et al. Biobanking. National guidelines. Moscow: Triumph Publ; 2022. 308 p. (In Russ.) EDN: JHMUXD</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Анисимов С.В., Ахмеров Т.М., Балановский О.П., и др. Биобанкирование. Национальное руководство. Москва: Издательство Триумф, 2022. 308 с. EDN: JHMUXD</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B2"><label>2.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Ogishima S. [Development of Biobank Network in Japan]. Gan To Kagaku Ryoho. 2022;49(2):125–128.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Ogishima S. [Development of Biobank Network in Japan] // Gan To Kagaku Ryoho. 2022. Vol. 49, N 2. P. 125–128.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B3"><label>3.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Dodulin YuV, Borisova AL, Pokrovskaya MS, et al. Current best practices and biobanking recommendations. Russian Clinical Laboratory Diagnosis. 2019;64(12):769–776. doi: 10.18821/0869-2084-2019-64-12-769-776 EDN: UPJHRW</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Додулин Ю.В., Борисова А.Л., Покровская М.С., идр. Современные передовые практики и рекомендации по биобанкированию // Клиническая Лабораторная Диагностика. 2019. Т. 64, № 12. С. 769–776. EDN: UPJHRW</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B4"><label>4.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Kalinin RS, Goleva OV, Illarionov RA, et al. Development of a biobank in the structure of scientific and diagnostic and treatment institutions and prospects for interregional integration. Cardiovascular. Therapy and Prevention. 2022;21(11):3401. doi: 10.15829/1728-8800-2022-3401</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Калинин Р.С., Голева О.В., Илларионов Р.А., и др. Формирование биобанка в структуре научных и лечебно-диагностических учреждений и перспективы межрегиональной интеграции// Кардиоваскулярная терапия и профилактика. 2022. Т. 21, № 11.С. 3401. doi: 10.15829/1728-8800-2022-3401</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B5"><label>5.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Reis FPD, Pêgo-Fernandes PM. Biobank – the key to personalized medicine. Sao Paulo Med J. 2022;140(5):625–626. doi: 10.1590/1516-3180.2022.1405.12072022</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Reis F.P.D., Pêgo-Fernandes P.M. Biobank – the key to personalized medicine// Sao Paulo Med J. 2022. Vol. 140, N 5. P. 625–626. doi: 10.1590/1516-3180.2022.1405.12072022</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B6"><label>6.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Chróścicka A, Paluch A, Kalaszczyńska I, Szabłowska-Gadomska I. Biobank Personnel — The Key to its Success. Alternatives to Laboratory Animals. 2022;50(4):275–281. doi: 10.1177/02611929221113976</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Chróścicka A., Paluch A., Kalaszczyńska I., Szabłowska-Gadomska I. Biobank Personnel — The Key to its Success // Alternatives to Laboratory Animals. 2022. Vol. 50, N 4. P. 275–281. doi: 10.1177/02611929221113976</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B7"><label>7.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Van Den Heuvel R, Den Hond E, Colles A, et al. Biobank@VITO: Biobanking the General Population in Flanders. Front Med. 2020;7:17. doi: 10.3389/fmed.2020.00037</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Van Den Heuvel R., Den Hond E., Colles A., et al. Biobank@VITO: Biobanking the General Population in Flanders // Front Med. 2020. Vol. 7. P. 17. doi: 10.3389/fmed.2020.00037</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B8"><label>8.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">MyakishevaYuV, Kolsanov AV, VlasovMYu, Sokolov AV. Noninvasive diagnosis of status of exchange processes in the organism: routine liquid markers. Modern Problems of Science and Education. 2017(5):14. EDN: ZQNFKZ</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Мякишева Ю.В., Колсанов А.В., Власов М.Ю., Соколов А.В. Неинвазивная диагностика состояния обменных процессов в организме: маркёры ротовой жидкости // Современные проблемы науки и образования. 2017. № 5. С. 14. EDN: ZQNFKZ</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B9"><label>9.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Woo JS, Lu DY. Procurement, Transportation, and Storage of Saliva, Buccal Swab, and Oral Wash Specimens. Yong W., editor. New York (NY): Humana Press; 2019. doi: 10.1007/978-1-4939-8935-5_10</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Woo J.S., Lu D.Y. Procurement, Transportation, and Storage of Saliva, Buccal Swab, and Oral Wash Specimens. YongW., editor. New York(NY): Humana Pressб 2019. doi: 10.1007/978-1-4939-8935-5_10</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B10"><label>10.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Bazarnyy VV, Polushina LG, Maksimova AYu. Laboratory study of buccal epithelium and oral fluid. Ekaterinburg: Ural State Medical University Publ.; 2019. 52 p. (In Russ.) EDN:HILQKB</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Базарный В.В., Полушина Л.Г., Максимова А.Ю. Лабораторное исследование буккального эпителия и ротовой жидкости: Учебное пособие. Екатеринбург: Издательство ФГБОУ ВО «Уральский государственный медицинский университет» Минздрава РФ, 2019. 52 c. EDN: HILQKB</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B11"><label>11.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Duś-Ilnicka I, Krala E, Cholewińska P, Radwan-Oczko M. The Use of Saliva as a Biosample in the Light of COVID-19. Diagnostics. 2021;11(10):1769. doi: 10.3390/diagnostics11101769</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Duś-Ilnicka I., Krala E., Cholewińska P., Radwan-Oczko M. The Use of Saliva as a Biosample in the Light of COVID-19 // Diagnostics. 2021. Vol. 11, N 10. P. 1769. doi: 10.3390/diagnostics11101769</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B12"><label>12.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Sivakova OV, Pokrovskaya MS, Metelskaya VA, et al. International rules for description of biospecimens are an important factor in improving the quality of researches. The Russian Journal of Preventive Medicine. 2019;22(6):95–99. doi: 10.17116/profmed20192206295</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Сивакова О.В., Покровская М.С., Метельская В.А., и др. Международные правила описания биообразцов — важный фактор повышения качества научных исследований // Профилактическая медицина. 2019. Т. 22, № 6. С. 95–99. doi: 10.17116/profmed20192206295</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B13"><label>13.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Kopenkin MA, Basova EA, Polushina LG, Bazarnyy VV. The stability of mixed saliva analytes under different centrifugation conditions. USMU Medical Bulletin. 2024(2):7–18. EDN: KRLRLO</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Копенкин М.А., Басова Е.А., Полушина Л.Г., Базарный В.В. Стабильность аналитов ротовой жидкости при разных условиях центрифугирования // Вестник УГМУ. 2024. № 2. С. 7–18. EDN: KRLRLO</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B14"><label>14.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Kudryavtseva EV, Mangileva YaA, Potapov NN, Polushina LG, Kovalyov VV. Anthropometric characteristics and features of systemic inflammation response in patients with endometriosis. Women's Health and Reproduction.2024(1). doi: 10.31550/2712-8598-2024-1-7-ZhZiR</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Кудрявцева Е.В., Мангилева Я.А., Потапов Н.Н., Полушина Л.Г., Ковалёв В.В. Антропометрические характеристики и особенности системного воспалительного ответа у пациенток с эндометриозом // Женское здоровье и репродукция. 2024. № 1 (62). doi: 10.31550/2712-8598-2024-1-7-ZhZiR</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B15"><label>15.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Mangileva YaA, Lyssenko AL, Shmeleva AS, Polushina LG, Kudryavtseva EV. Salivary markers of endometriosis. USMU Medical Bulletin.2023(1):8–20. EDN: AQYALG</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Мангилева Я.А., Лысенко А.Л., Шмелева А.С., Полушина Л.Г., Кудрявцева Е.В. Саливарные маркеры эндометриоза // Вестник УГМУ. 2023. № 1. С. 8–20. EDN: AQYALG</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="B16"><label>16.</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="en">Kopenkin MA, Polushina LG, Sementsova EA, Mandra YuV, Bazarnyi VV. Сhange features of saliva biochemical parameters during aging. Russian Clinical Laboratory Diagnostics. 2024;69(3):108–115. EDN: EDNYPG doi: 10.51620/0869-2084-2024-69-3-108-115</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="ru">Копенкин М.А., Полушина Л.Г., Семенцова Е.А., Мандра Ю.В., Базарный В.В. Биохимические особенности ротовой жидкости при старении // Клиническая лабораторная диагностика. 2024. Т. 69, № 3. С. 108–115. EDN: EDNYPG doi: 10.51620/0869-2084-2024-69-3-108-115</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list></back></article>
