О методических ошибках оценивания начальных скоростей ферментативных реакций и способах их коррекции (на примере лактатдегидрогеназы)

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Представлен универсальный алгоритм расчета начальных скоростей ферментативных реакций в «нулевой» момент времени по кинетической кривой расхода субстрата или накопления продукта при проведении прямых кинетических измерений активности ферментов. Исследование выполнено на примере коммерческого препарата лактатдегидрогеназы и стандартного биохимического набора реагентов. Предлагаемый подход позволяет практически исключить систематическую ошибку измерений, с одинаковой точностью определять начальную скорость реакции независимо от уровня активности ферментов, сократить до одной минуты время выполнения анализов, а также расширить сферу применения стандартных наборов реагентов для исследования образцов ферментов разного происхождения при решении широкого круга задач. Алгоритм не может применяться при использовании в аналитической процедуре систем сопряженных ферментов, поскольку на кинетических кривых в этом случае имеется длительная начальная лаг-фаза.

Об авторах

А. Ю Лянгузов

Санкт-Петербургский государственный университет

Email: andrey.lyanguzov@spbu.ru
Санкт-Петербург, Россия

Н. М Малыгина

Санкт-Петербургский государственный университет;Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова

Санкт-Петербург, Россия

Т. А Петрова

Санкт-Петербургский государственный университет

Санкт-Петербург, Россия

Список литературы

  1. Spinreact, https://www.spinreact.com. Дата обращения: 10.05.2023.
  2. M. Meerkin, in Tietz cinical guide to laboratory tests, Ed. by A. H. B. Wu (W.B. Saunders Company, Danvers, 2006), pp. 648-б5о.
  3. A. Chang, L. Jeske, S. Ulbrich, et al., Nucl. Acids Res., 49, D498 (2021).
  4. Enzyme Nomenclature, http://www.enzyme-data-base.org/contents.php. Дата обращения: 10.05.2023.
  5. L. S. Vidal, C. L. Kelly, P. M. Mordaka, and J. T. Heap, Biochim. Biophys. Acta: Proteins Proteomics, 1866, 327 (2018).
  6. UV WinLab Software 6.0.4 (PerkinElmer Lambda 35), http://www.perkinelmer.com. Дата обращения: 10.05.2023.
  7. R Project, https://www.r-project.org. Дата обращения: 10.05.20223.
  8. N. M. Malygina, T. A. Petrova, A. Yu. Lianguzov, and A. M. Ivanov, Dokl. Biochem. Biophys., 488, 311 (2019).
  9. Products/Clinical Biochemistry/Enzymes, https://www.spinreact.com/en/products-list/clinical-biochemistry/enzymes.html. Дата обращения: 10.05.2023.
  10. W. W. Cleland, Anal. Biochem., 99, 142 (1979).
  11. A. Yu. Lyangusov, T. A. Petrova, and V. E. Stefanov. Dokl. Biochem. Biophys., 424, 49 (2009).

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Российская академия наук, 2023