Том 69, № 9 (2024)

Обоснование. Инфекции, вызванные анаэробными бактериями, несут высокий риск для жизни, часто протекают в тяжёлой форме и опасны для пациентов с сопутствующими заболеваниями. Несмотря на это, в рутинной практике микробиологических лабораторий обычно анаэробов не культивируют и не идентифицируют, редко проводят определение чувствительности облигатно-анаэробных бактерий к антибиотикам. В то же время в мировой практике отмечается рост антибиотикорезистентности, в том числе и среди анаэробных бактерий.

Цель — изучение чувствительности этиологически значимых видов облигатно-анаэробных бактерий, выделенных от пациентов колопроктологического профиля из различных регионов Российской Федерации.

Материалы и методы. В многоцентровое проспективное неконтролируемое исследование включены этиологически значимые облигатно-анаэробные бактерии, выделенные от пациентов колопроктологического профиля из 65 регионов Российской Федерации, с последующей оценкой чувствительности к антибиотикам в соответствии с нормативными документами, применяемыми в Российской Федерации.

Результаты. В результате проведённого исследования собрана коллекция из 1200 штаммов облигатно-анаэробных бактерий, относящихся к 123 видам. В анализ включены результаты тестирования чувствительности 430 штаммов бактерий, возбудителей анаэробных инфекций в колопроктологии, из них бактерии рода Bacteroides (n =202), рода Parabacteroides (n =22), Phocaeicola vulgatus (n =104), рода Prevotella (n =11), Clostridium perfringens (n =91). Среди штаммов выявлена резистентность до 77,3% к метронидазолу, до 72,7% — к клиндамицину, до 62,5% — к меропенему, до 8,79% — к ванкомицину.

Заключение. Мониторинг резистентности к антимикробным препаратам облигатно-анаэробных бактерий, представляющих угрозу распространения антибиотикорезистентных штаммов, позволяет снизить уровень распространения резистентности, а также персонализировать протоколы антимикробной терапии и профилактики пациентов с целью снижения стоимости лечения и времени пребывания пациента в стационаре за счёт быстрого перехода с эмпирической на этиотропную терапию.

Обоснование. Антибиотикорезистентность возбудителей нозокомиальной пневмонии (НП), в первую очередь, их устойчивость к карбапенемам, представляет серьёзную проблему для здравоохранения. Для своевременного назначения эффективной антимикробной терапии требуются новые быстрые и чувствительные методы диагностики. Разработка и внедрение диагностических тестов на основе молекулярных методов, включая полимеразную цепную реакцию (ПЦР) и перспективные технологии изотермической амплификации, позволит значительно сократить время получения результатов и повысить эффективность выявления возбудителей НП, обладающих генами карбапенемаз.

Цель — проведение сравнительной оценки эффективности нового теста на основе петлевой изотермической амплификации (LAMP) для выявления генов карбапенемаз групп NDM, OXA-48 и KPC, используемых в практике лабораторной диагностики тестов на основе полимеразной цепной реакции с детекцией в режиме реального времени при применении их в диагностике нозокомиальных инфекций нижних дыхательных путей, в том числе нозокомиальной пневмонии.

Материалы и методы. В исследование включён 141 образец биоматериала из нижних дыхательных путей от 107 пациентов с нозокомиальной инфекцией нижних дыхательных путей (нозокомиальной пневмонией и/или гнойным трахеобронхитом). Биоматериал представлял из себя аспират из трахеи (ТА, n=78), бронхоальвеолярный лаваж (БАЛ, n=29) и мокроту (n=34). Нуклеиновые кислоты выделяли с использованием набора «АмплиТест® РИБО-преп». Гены NDM, OXA-48 и KPC анализировали с помощью разработанного набора реагентов «АмплиТест® CP NDM/OXA-48/KPC LAMP» на основе метода петлевой изотермической амплификации. Для сравнения результатов применяли метод ПЦР в режиме «реального времени» с использованием наборов реагентов «АмплиСенс® MDR MBL-FL» и «АмплиСенс® MDR KPC/OXA-48-FL».

Результаты. Получены совпадающие результаты выявления генов карбапенемаз групп NDM, OXA-48 и KPC в образцах биоматериала из нижних дыхательных путей при использовании нового теста на основе изотермической амплификации и с помощью ПЦР-тестов для всех исследованных образцов. С помощью критерия TTP (Time to positivity — время до положительного результата) показано ускоренное время получения результата LAMP в сравнении с ПЦР. С помощью дополнительных ПЦР-тестов были определены грамотрицательные микроорганизмы, присутствующие в исследуемых образцах (как в индивидуальной, так и в смешанной форме).

Заключение. Согласно полученным результатам, эффективность выявления генов карбапенемаз указанных групп с помощью нового теста на основе LAMP не уступает эффективности их выявления с помощью ранее внедрённых в практику ПЦР-тестов.

Биобанк — это уникальная платформа для современных прикладных и фундаментальных биомедицинских исследований. Данное подразделение занимается не только хранением биологических образцов, но и систематизацией клинической, лабораторной информации по каждой пробе. В 2023 г. было принято решение сформировать биобанк на базе Центральной научно-исследовательской лаборатории Уральского государственного медицинского университета. Для начала было необходимо выбрать один тип биоматериала для создания коллекции и ассоциированной с ней информации. Поскольку нашим коллективом длительное время изучались биомаркеры ротовой жидкости, было принято решение создать первую коллекцию из образцов указанного биоматериала.

Цель настоящей работы — представление опыта организации университетского биобанка на основе создания коллекции образцов ротовой жидкости. В статье рассматриваются основные этапы создания и функционирования биобанка, описываются методы пробоподготовки ротовой жидкости, а также приводится статистика собранных коллекций. На сегодняшний день преобладающая часть депозитария состоит из образцов ротовой жидкости условно здоровых пациентов и пациентов с различной патологией. На биоматериале из собранных коллекций биобанка выполнялись исследования по поиску прогностических биомаркеров различных патологических состояний.

Таким образом, университетский биобанк — это возможность для сотрудников университета, которая поможет повысить качество и воспроизводимость научно-исследовательских работ и клинико-экспериментальных проектов.